要进入口袋妖怪火红中的遗迹山谷，玩家首先需要完成游戏的主线剧情，并将图鉴升级到386版。这涉及前往博士处进行图鉴升级，然后通过坐船到达火焰山，在右边的山洞内使用怪力技能推动石头获取红宝石。将红宝石交给博士后，玩家可以获得船票，从而解锁前往其他七个岛屿的航线。这个前置条件是进入遗迹山谷的基础，确保玩家已经进展到游戏的后期阶段。
获得船票后，玩家可以乘坐船只前往六号岛。到达六号岛后，需要前往宝可梦中心，与小茂对话以触发相关剧情。这个对话提供了进入遗迹山谷的线索，并推动故事发展。六号岛是七岛任务线的一部分，玩家需要先完成四号岛和五号岛的相关事件，例如在四号岛的冰洞中获取登瀑布技能，并在五号岛收集道具触发剧情，才能顺利进入遗迹山谷区域。
在六号岛，玩家从宝可梦中心出发，向南或向右使用冲浪技能穿越水域，即可抵达遗迹山谷的入口。途中需要使用居合斩技能砍断挡路的树木，以打开通道。遗迹山谷位于六号岛的右侧区域，是连接绿色小径和变化洞穴的过渡地带，地形包括岩道和草丛，可能遇到使用草系和水系宝可梦的训练师对战。玩家需要提前准备好必要的秘传机技能和回复道具，以应对沿途的挑战。
进入遗迹山谷的洞穴后，玩家会面临一个迷宫结构。需要按照上、左、右、下的顺序行进到底层，才能触发剧情并获得蓝宝石。在洞穴内，可能遇到训练师对战，并需要使用劲力技能推动石头来解谜。洞穴内部设有简单迷宫，推动特定石块可以开启隐藏石室，每个石室内有一只未知图腾，可供捕捉以填满图鉴。拿到蓝宝石后，会被火箭队成员抢走，但同时会获得一个密码，用于后续在五号岛的火箭队仓库中解锁新区域。
完成遗迹山谷的探索后，玩家可以返回五号岛，在火箭队仓库输入获得的密码，击败火箭队并拿回蓝宝石。遗迹山谷附近还有其他区域如绿色小径和变化洞穴，可以捕捉稀有宝可梦如赫拉克罗斯。建议玩家在探索前准备好回复道具、解毒药和必要的秘传机技能，洞穴内的野生宝可梦以超音蝠和穿山鼠为主，等级在35-40之间，因此需要提前准备克制技能以应对战斗。
遗迹山谷的冒险是游戏二周目内容的重要组成部分，完成后可以继续探索七号岛的阿斯卡纳遗迹或返回华蓝市进入华蓝洞穴捕捉超梦。整个流程虽然较长，但按步骤进行可以顺利进入并完成探索，同时为后续游戏内容奠定基础。玩家应注意保存游戏进度，并合理分配资源以确保探索效率。
