忍界大战团本是一个包含四座城堡的硬核副本，每座城堡的终点都设有强大的首领，玩家需要组建四人小队逐一攻克，关卡推进难度显著提升，提前熟悉打法至关重要。
挑战城堡时，首领战通常分阶段进行，例如初始阶段首领会频繁飞天并下落砸击，在生命值约九条时召唤四个分身，分身以飞天落地和直线冲击模式交替攻击，第三阶段分身的攻击会停止，地图上出现治疗卷轴，玩家需拾取并使用以恢复状态，随后首领真身再现，继续使用类似攻击模式，但必须警惕屏幕提示的黑祸攻击，及时逃离地上的黑色长方形范围以避免秒杀，同时注意躲避预先显示虚线的火圈。
为了提升通关效率，玩家应注重忍者和忍具的培养，合理选择和升级忍具能大幅增强战斗力，同时技能搭配和团队合作也不可忽视，加入公会后与其他玩家协作可以获得更多资源，正确组合技能和忍具能在战斗中发挥更高输出，通过收集忍者并消耗碎片升星来获得阵容属性加成，召唤和升级忍具在忍具页面消耗忍具和锻造石可以提升等级并激活特殊效果，通灵兽的召唤和修炼也能提供额外属性增益。
充分利用治疗卷轴维持生存是关键，尤其是在躲避多重攻击时，首领会间歇性施展黑祸攻击，需持续关注地面范围提示并及时避开，抓住首领技能冷却的间隙灵活移动并全力输出伤害，通过反复周旋逐渐消耗其生命值直至胜利，注意首领在砸地时灵活躲开并在其技能冷却时打出伤害是制胜要点。
